Ihre Werke befinden sich u.a. in:
Österreichische Galerie Belvedere, Wien
Neue Galerie der Stadt Linz
Graphische Sammlung Albertina, Wien
Leopold Museum, Wien
Historisches Museum der Stadt Wien
Kunstsammlungen Chemnitz
Universität für angewandte Kunst, Wien
The British Museum,
Department of Prints and Drawings, London
Privatbesitz
Kunsthandel
 
Derzeit bekannte Signaturen:
"Helene Funke", "Hel Funke"
"H. Funke", "Funke"
"He Funke", "H.F.", "F"
Oftmals mit genauer Datumsangabe 
 
Werkbeispiele:
  " Mädchen
aus Ungarn",
vor 1911, Öl		  
   
  "Musik",
um 1919, Öl

Das Bild wurde 1920 durch das Bundesministerium
für Bildung,
Wissenschaft und
Kultur gekauft und
der Zentraldirektion
der Staatser-
ziehungsanstalten
für die Anstalt für Mädchen, Wien XVII,
zur Verfügung gestellt. (heute verschollen)		  
   
  "Bretonisches Mädchen",
vor 1914,
sign. re. unten,
Öl auf Leinwand,
85 x 69 cm		  
   
  "Frauengruppe
mit vier Frauen",
1916, Öl 		  
   
  "In der Loge",
vor 1917, Öl 		 
   
  "Bretonische Fischersfrau",
vor 1914, Öl		  
   
  "Bretonische Bäuerinnen", 1918/19, lebensgroß

Das Bild wurde wahrscheinlich von der Künstlerin zerstört, die abgebildeten Kostüme an das Museum für Angewandte Kunst verkauft.		  
   
  "Halleluja"
bzw. "Nacht"
um 1925, Öl,
215 x 90 cm		  
   
  "Frauenkopf" bzw. "Ninon Dolbin"
sign. re. unten:
"H.F. 25",
ehemals Besitz
in Berlin. Heute wahrscheinlich USA.		  
   
  "Jakobs Traum",
1930er Jahre, Öl		  
   
  Stilleben mit Birnen, Obstschale und Krug,
vor/um 1919,
Öl,
sign. re. unten: "Funke"		  
   
  Stillleben mit Äpfeln, 1920,
sign. und datiert
"Funke 20",
Öl auf Leinwand,
30 x 40 cm, etw. beschnitten		  
   
  "Wildbach",
sign. "F", Aquarell
auf Papier,
34,2 x 24 cm,
auf der Rückseite Nachlassstempel		  
   
  "Stilleben mit Zwiebeln, Büchern und Gefäßen,
Öl auf Leinwand, sign. "Funke",
60 x 73 cm,
links beschnitten
   
  "Visionen",
1920/21,
Öl auf Leinwand,
sign. u. datiert:
"H. Funke
1920-21",
102 x 90 cm		  
   
  "Fischerhäuser",
um 1903, auf der Rückseite betitelt,
sign. "Helene Funke",
"03 München",
Gouache auf Papier,
auf Karton,
44,5 x 62 cm		  
   
  Stilleben mit Blumenvase, Muschel und Äpfel, um 1900,
sign. re. unten
"H. Funke",
Öl auf Leinwand,
40 x 50 cm